La peste negra fué causada por una bacteria cuyo genoma completo ha logrado secuenciar un equipo internacional de científicos. Es la primera vez que se logra reconstruir un genoma completo de un patógeno tan antiguo, lo que permite seguir el rastro de los cambios de su evolució y virulencia. Los científicos han podido indentificar esto gracias a una nueva tecnología desarrollada por ellos, para obtener y purificar fragmentos de ADN degradados del antiguo patógeno. Los análisis genéticos también han permitido determinar el origen de aquella cepa mortífera entre el siglo XII y XIII. La epidemia más antigua (que arrasó Roma) fué causada por otro patógeno diferente.
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